45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2311 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  86.75 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  43.64 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  41.13 
 
 		 232 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  40.52 
 
 		 453 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  42.39 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  42.39 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  42.39 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  42.27 
 
 		 219 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  38.27 
 
 		 532 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  41.01 
 
 		 236 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  41.2 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  38.98 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  39.13 
 
 		 449 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  41.48 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  37.84 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  39.15 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  39.46 
 
 		 222 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  38.32 
 
 		 239 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  36.44 
 
 		 225 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  39.66 
 
 		 222 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  33.63 
 
 		 225 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  34.26 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  36.49 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  32.38 
 
 		 231 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  34.58 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  32.87 
 
 		 221 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  33.82 
 
 		 202 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  32.42 
 
 		 218 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  32.86 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  31.8 
 
 		 216 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  32.21 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  28.91 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  28.02 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  28.76 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  26.47 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  29.13 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  27.69 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  27.89 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  28.19 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  29.86 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  29.53 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  29.86 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>