122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0954 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0954  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
254 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0978354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3774  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  67.77 
 
 
239 aa  286  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0153144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.24 
 
 
600 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  22.18 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.25 
 
 
227 aa  62  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.32 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.39 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  24.9 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.14 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.65 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3045  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.38 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.84 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.43 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.95 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.772379 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.97 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1800  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.08 
 
 
280 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.52 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.08 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.64 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1116  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.35 
 
 
337 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.27 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  38.39 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.4 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.27 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.71 
 
 
594 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.19 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3752  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.85 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00938184  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3985  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.62 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.15 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0569  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.3 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.68 
 
 
341 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  50.91 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.43 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.11 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.28 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0199  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.57 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.4 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.53 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.0753834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.42 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4047  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.15 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0615  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.92 
 
 
341 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.131346  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
228 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.08 
 
 
229 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000121711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.83 
 
 
239 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  49.02 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02000  glycerophosphodiester phosphodiesterase, putative  52.08 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.98 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1460  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.94 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.8 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.08 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1345  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.05 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01040  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.4 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4513  glycerophosphodiester phosphodiesterase  42.35 
 
 
263 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
318 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.32 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30810  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.48 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1803  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.79 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.92 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.08 
 
 
258 aa  45.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0834008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.36 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1686  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000482632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  22.49 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.75 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.05 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6134  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916586  normal  0.272485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2973  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.28 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0885  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.93 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0088343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.44 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  48 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.95 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.14 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.14 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1217  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  48.94 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.79 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  35.35 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  34.34 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.61 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.1 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.92 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00970599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.59 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.79 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  47.54 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0853  glycerophosphodiester phosphodiesterase  50 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  44.68 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  45.1 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04050  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
373 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.991162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4391  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  45.1 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1464  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46 
 
 
327 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  26.17 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  45.1 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000031026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.71 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.92 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5023  glycerophosphodiester phosphodiesterase  43.04 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215584  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>