96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3774 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3774  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0954  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  67.77 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0978354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.15 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3045  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.17 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.27 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.62 
 
 		 600 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.15 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1800  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.86 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.51 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.77 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.46 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.38 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0834008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.69 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  36.08 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3752  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.63 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00938184  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.59 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.15 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  36.08 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.06 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00970599  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.05 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  21.83 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  48.08 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.63 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.46 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0615  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.32 
 
 		 341 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.131346  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.67 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.4 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2973  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.08 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.69 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1345  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.08 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.58 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.81 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  50 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.19 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.65 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  26.67 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0569  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.43 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  24.58 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.85 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.46 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.0753834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.33 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.772379 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1460  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.23 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.79 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.42 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  22.36 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.78 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.36 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.58 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.61 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4812  predicted protein  47.62 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.11 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000121711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2671  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.94 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.46 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.92 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1584  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.45 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.71 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.35 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.86 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  32.73 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1116  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.15 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.13 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.71 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.58 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.35 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  23.75 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.98 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6134  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.93 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916586  normal  0.272485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30810  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.33 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2061  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.09 
 
 		 604 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.36158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.35 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.19 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.35 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.89 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.3 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.02 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.94 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0950  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  22.57 
 
 		 357 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  21.65 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.35 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  25.42 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1803  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.35 
 
 		 248 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.55 
 
 		 252 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1217  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.85 
 
 		 296 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02000  glycerophosphodiester phosphodiesterase, putative  48.89 
 
 		 349 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4047  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.11 
 
 		 222 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  43.75 
 
 		 229 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.56 
 
 		 241 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.07 
 
 		 239 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.45389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0199  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.01 
 
 		 305 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.58 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>