More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4116 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4116  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  51.77 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  47.89 
 
 		 143 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  48.59 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  48.91 
 
 		 141 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  48.57 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  48.23 
 
 		 144 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  47.55 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 142 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 143 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  47.89 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  46.48 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  46.85 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  45.45 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  48.18 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  46.72 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  45.99 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  45.99 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  47.48 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  45.65 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 142 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  46.72 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  45.71 
 
 		 143 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  45.26 
 
 		 141 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  43.8 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  46.38 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  45.45 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  48.91 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  48.84 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  48.91 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  48.18 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  46.04 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  44.93 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  42.75 
 
 		 141 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  44.76 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  44.76 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  43.07 
 
 		 142 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  48.18 
 
 		 140 aa  121  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  45.26 
 
 		 141 aa  121  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  43.07 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  43.07 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  43.8 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  43.48 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  43.48 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  45.77 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  42.96 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  43.48 
 
 		 141 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  43.57 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 		 141 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  44.68 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  42.55 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  44.29 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0387  ribosomal protein L11  46.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  46.72 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  41.96 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  43.48 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 144 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  45.19 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  42.14 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  44.2 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  45.93 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  42.75 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  43.48 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  44.29 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  47.66 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  42.34 
 
 		 141 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 140 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>