21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1569 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  100 
 
 		 489 aa  933    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  63.33 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  38.5 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  39.18 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  35.34 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  34.99 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  32.45 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  40.45 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  30.24 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  30.05 
 
 		 419 aa  143  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  31.83 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  27.65 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  28.52 
 
 		 471 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  25.69 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  28.47 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  28.83 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  21.89 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  28.69 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2934  hypothetical protein  30.97 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.65 
 
 		 503 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>