79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4971 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  37.74 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  29.44 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  27.59 
 
 
258 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  27.52 
 
 
309 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  30.5 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  30.12 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  28.52 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  29.57 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  29.73 
 
 
257 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
298 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  31.06 
 
 
259 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  27.95 
 
 
257 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
255 aa  105  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.79 
 
 
304 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  27.95 
 
 
299 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  27.52 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  28.51 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  28.77 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.94 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  25.86 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  33.33 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.17 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  28.29 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.79 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.9 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  28.81 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  24.12 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  27.17 
 
 
282 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  22.09 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  26.46 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  23.62 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.56 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  23.33 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  23.79 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  25.27 
 
 
356 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  24.6 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.67 
 
 
376 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  25.31 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  26.06 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.13 
 
 
364 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  25.19 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  27.46 
 
 
366 aa  48.9  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  24.88 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  24.42 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  26.09 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.94 
 
 
372 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.03 
 
 
354 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  23.28 
 
 
261 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  27.23 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  21.92 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.81 
 
 
362 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  25.52 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.51 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  26.04 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  24.06 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2032  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.60548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  23.5 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  26.7 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  24.74 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  23.7 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  22.1 
 
 
351 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  24.08 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  23.41 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  20.81 
 
 
350 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  25.25 
 
 
320 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 
225 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  21.47 
 
 
369 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>