90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3790 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3790  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.724795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1116  cyclic nucleotide binding regulatory protein  26.42 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0678  cyclic nucleotide binding-regulatory protein  28.12 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2093  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177732  normal  0.144661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.15 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153014  normal  0.0498746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2773  cyclic nucleotide-binding protein  27.03 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.724509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1379  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.54 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0484  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.23 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0397  cyclic nucleotide binding regulatory protein  22.16 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.081454  normal  0.179633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6003  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1740  cyclic nucleotide-binding protein  27.11 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4303  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.814789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2876  cyclic nucleotide binding regulatory protein  24.75 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132112  decreased coverage  0.0000795763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4002  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.99 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000843344  normal  0.0193683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4604  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2676  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3131  cyclic nucleotide-binding protein  27.06 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2655  cyclic nucleotide-binding protein  22.4 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.964381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1544  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.13 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1392  cyclic nucleotide-binding protein  24.72 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3164  cyclic nucleotide-binding protein  22.87 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3466  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.99 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4260  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  normal  0.714837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0358  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00654303  normal  0.458224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2485  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.57 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3193  cyclic nucleotide-binding protein  26.06 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3733  cyclic nucleotide-binding protein  24.02 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.263018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6135  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2871  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.16 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00453056  normal  0.032413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5649  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.78 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1763  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.73 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000036343  normal  0.326349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0777  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.38 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4057  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1942  cyclic nucleotide binding regulatory protein  23.91 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0673232  normal  0.0303448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0226  cyclic nucleotide binding regulatory protein  26.22 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2316  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2731  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.72 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4579  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3294  cyclic nucleotide-binding protein  27.85 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3811  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000424925  normal  0.837205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10168  hypothetical protein  22.58 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1677  cyclic nucleotide binding regulatory protein  24.35 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.24852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3997  cyclic nucleotide-binding protein  22.86 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1090  cyclic nucleotide binding regulatory protein  25.79 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0851  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1779  cyclic nucleotide-binding  24.19 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.705859  normal  0.0224927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0028  cyclic nucleotide-binding protein  26.95 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1138  cyclic nucleotide-binding protein  24.14 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0914153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2257  cyclic nucleotide binding regulatory protein  29.34 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0921421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1119  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301792  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2178  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3830  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.11 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.695222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.19 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.560798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1351  cyclic nucleotide-binding  24.42 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2769  cyclic nucleotide-binding  26.67 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.311339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3995  cyclic nucleotide-binding protein  22.7 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0432337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0259  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.0138145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1758  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.972019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.95 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5018  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.65 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213439  normal  0.0399909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3750  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.86 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4064  cyclic nucleotide-binding protein  21.62 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0933  cyclic nucleotide-binding protein  23.93 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0517277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3646  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0908146  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1286  cyclic nucleotide binding regulatory protein  23.65 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4424  cyclic nucleotide-binding protein  23.71 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3758  cyclic nucleotide-binding  23.68 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2881  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.98 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4533  cyclic nucleotide-binding protein  20.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2540  cyclic nucleotide binding regulatory protein  24.39 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3814  cyclic nucleotide-binding protein  22.34 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2747  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.65 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4629  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483165  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2892  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4313  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.72 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.352776  normal  0.0805957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0889  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.69 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205469  normal  0.913069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5637  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.56 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236441  normal  0.598189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3085  cyclic nucleotide-binding protein  22.28 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10488  hypothetical protein  24.68 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0302  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1290  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.95 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.981443  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1692  cyclic nucleotide-binding protein  24.16 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2259  cyclic nucleotide binding regulatory protein  23.73 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6187  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.68 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1452  cyclic nucleotide binding regulatory protein  20.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177546  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1592  cyclic nucleotide-binding protein  23.12 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.619308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3057  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.63 
 
 		 186 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5631  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 		 197 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.344618  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3259  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.42 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>