37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3648 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  281  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  99.28 
 
 		 138 aa  279  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  76.81 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  76.26 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  76.09 
 
 		 136 aa  210  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 135 aa  207  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  74.8 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 127 aa  176  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 131 aa  163  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  60.14 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 137 aa  153  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  46.94 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  40.44 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  39.23 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  40.88 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  44.78 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  39.29 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  41.04 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  38.81 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  40.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  35.48 
 
 		 256 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  35.48 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>