47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3199 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  413  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  57.5 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  31.63 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  38.24 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  27.07 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  35.33 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  34.4 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  27.93 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  34.06 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  32.07 
 
 		 247 aa  71.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  34.53 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  32.75 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  38.52 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  30.4 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  33.11 
 
 		 414 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  31.2 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  33.77 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  33.11 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  33.11 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  31.03 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  31.01 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  31.01 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  28.45 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  32.81 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  32.43 
 
 		 407 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  33.86 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  34.04 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  34.04 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  27.89 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  30.39 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  34.65 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  29.45 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  38.3 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  30.5 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  37.6 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  35.38 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  39.29 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  40.74 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  32.24 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>