47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2070 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  67.09 
 
 
242 aa  332  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  66.67 
 
 
241 aa  314  8e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  55.46 
 
 
242 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  56.19 
 
 
226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  55.41 
 
 
235 aa  241  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  51.05 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  48.89 
 
 
251 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  44.6 
 
 
244 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  48.13 
 
 
226 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  46.41 
 
 
243 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  48.35 
 
 
236 aa  175  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  44.44 
 
 
237 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  46.19 
 
 
255 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  50.93 
 
 
240 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  46.7 
 
 
247 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  43.41 
 
 
245 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  43.2 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  40.83 
 
 
238 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  41.82 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  41.82 
 
 
225 aa  161  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  38.53 
 
 
237 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  36.32 
 
 
248 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  37.09 
 
 
212 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  42.29 
 
 
174 aa  148  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  43.41 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  39.23 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  39.23 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  39.46 
 
 
222 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  38.97 
 
 
407 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  38.46 
 
 
407 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  37.67 
 
 
414 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  37.67 
 
 
414 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  36.81 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  41.78 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  45.21 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  40.23 
 
 
202 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  37.78 
 
 
212 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  37.84 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  34.64 
 
 
213 aa  101  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  37.33 
 
 
239 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  36.2 
 
 
245 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  34.12 
 
 
230 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  38.24 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  30.39 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  33.73 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>