47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2096 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  62.1 
 
 		 242 aa  274  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  56.19 
 
 		 241 aa  254  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  51.36 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  53.3 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  57.38 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  52.91 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  47.89 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  48.59 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  49.74 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  45.6 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  47.06 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  42.59 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  41.33 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  46.29 
 
 		 174 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  41.78 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  43.32 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  45.5 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  36.68 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  42.78 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  49.06 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  41.95 
 
 		 407 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  41.38 
 
 		 407 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  43.5 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  40.09 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  42.77 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  39.78 
 
 		 414 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  39.78 
 
 		 414 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  39.35 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  42.69 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  42.69 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  38.26 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  42.36 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  39.86 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  38.22 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  43.55 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  42.74 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  35.86 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  34.12 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  35.26 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  34.53 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  31.69 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  33.09 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  30.86 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  28.98 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>