47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3377 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  63.56 
 
 
236 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  57.21 
 
 
247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  59.72 
 
 
226 aa  255  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  57.81 
 
 
243 aa  230  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  53.46 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  46.86 
 
 
245 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  46.86 
 
 
245 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  49.74 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  45.5 
 
 
225 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  45.5 
 
 
225 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  42.92 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  45.99 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  53.59 
 
 
255 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  46.45 
 
 
242 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  43.24 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  50.98 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  43.68 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  44.69 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  51.08 
 
 
212 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  39.18 
 
 
407 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  51.33 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  38.66 
 
 
407 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  51.08 
 
 
174 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  40.84 
 
 
251 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  39.02 
 
 
215 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  39.02 
 
 
215 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  43.33 
 
 
241 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  37.95 
 
 
414 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  37.95 
 
 
414 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  43.59 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  39.7 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  38.05 
 
 
248 aa  141  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  36.61 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 
211 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  35.06 
 
 
210 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  34.48 
 
 
239 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  35.23 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  35.12 
 
 
212 aa  95.1  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  37.57 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  34.25 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  37.32 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  29.2 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  23.53 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>