47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1662 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  98.67 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  49.47 
 
 
243 aa  198  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  44.84 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  45.5 
 
 
241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  50 
 
 
414 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  50 
 
 
414 aa  194  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  47.55 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  47.09 
 
 
245 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  42.44 
 
 
407 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  46.34 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  42.44 
 
 
407 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  50.26 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  42.86 
 
 
215 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  42.86 
 
 
215 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  44.04 
 
 
247 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  49.72 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  53.5 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  44.86 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  41.13 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  51.23 
 
 
174 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  44.44 
 
 
251 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  49.47 
 
 
241 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  42.47 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  41.82 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  45.45 
 
 
241 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  46.15 
 
 
235 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  45.5 
 
 
226 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  47.5 
 
 
255 aa  154  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  42.38 
 
 
244 aa  154  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  39.42 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  39.29 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  39.34 
 
 
222 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  32.95 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  32.95 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  35.1 
 
 
208 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  35.62 
 
 
239 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  33.94 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  34.09 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  35.46 
 
 
245 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  34.01 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  34.92 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  31.01 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  31.01 
 
 
240 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  27.03 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>