47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2471 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  64.91 
 
 		 242 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  66.67 
 
 		 241 aa  314  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  51.08 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  62.03 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  51.36 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  42.22 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  49.43 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  49.17 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  53.55 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  42.27 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  42.38 
 
 		 236 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  45.31 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  49.47 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  50.87 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  46.56 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  43.58 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  42.29 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  46.03 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  38.97 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  43.33 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  49.3 
 
 		 174 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  40.95 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  40.95 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  43.72 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  36.65 
 
 		 248 aa  144  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  36.49 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  45.22 
 
 		 407 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  44.59 
 
 		 407 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  34.65 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  38.78 
 
 		 414 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  38.78 
 
 		 414 aa  128  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  35.83 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  37.02 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  44.52 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  41.45 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  37.93 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  45.24 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  32 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  36.02 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  35.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  34 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  32.48 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  30.56 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>