47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3936 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  45.42 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  48.33 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  50.56 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  42.98 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  45.75 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  52.91 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  48.89 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  42.22 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  41.33 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  46.74 
 
 		 235 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  48.66 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  45.45 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  48.7 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  40.85 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  48.73 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  38.78 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  53.24 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  46.02 
 
 		 174 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  41.84 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  47.47 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  40.84 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  38.84 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  44.62 
 
 		 407 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  44.62 
 
 		 407 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  46.99 
 
 		 414 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  38.95 
 
 		 226 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  46.39 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  42.44 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  42.44 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  38.42 
 
 		 208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  42.05 
 
 		 210 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  37.64 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  37.14 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  36.99 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  35.94 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  39.86 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 		 207 aa  88.6  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  34.34 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  34.06 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  32.85 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  26.94 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>