42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3600 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  36.28 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  38.54 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  30.39 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  32.85 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  32.8 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  33.09 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  30.34 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  31.88 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  33.1 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  34.03 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  30.34 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  36.67 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  30.86 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  32 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  31.08 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  35.25 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  35 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  35 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  33.61 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  30.15 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  30.63 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  30.56 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  28.08 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  28.08 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  32 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  30.83 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  33.61 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  31.01 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  27.74 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  31.01 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  42.53 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  30.23 
 
 		 174 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  30.83 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  30.65 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  32.41 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  43.18 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>