46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  97.14 
 
 		 245 aa  483  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  71.62 
 
 		 238 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  53.72 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  49.76 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  45.89 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  52.36 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  50.28 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  48.06 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  47.09 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  44.26 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  44.72 
 
 		 407 aa  178  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  44.72 
 
 		 407 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  41.28 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  43.2 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  49.37 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  38.78 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  40.5 
 
 		 414 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  40.5 
 
 		 414 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  46.03 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  44.13 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  40.71 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  44.23 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  43.27 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  43.27 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  48.61 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  43.14 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  50.71 
 
 		 212 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  43.67 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  43.53 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  39.44 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  39.35 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  38.61 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  34.58 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  38.86 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  39.78 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  39.86 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  36.02 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  41.96 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  39.72 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  33.52 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  34.93 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  29.45 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  28.08 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>