45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3982 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  57.5 
 
 
200 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  38.54 
 
 
240 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  35.53 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  34.07 
 
 
251 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  34.22 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  32.14 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  34.13 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  37.16 
 
 
414 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  32.6 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  36.49 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  34.78 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  28.32 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  28.66 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  34.22 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  34.03 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  36.97 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  30.65 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  33.57 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  33.8 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  33.16 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  30.81 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  30.72 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  30.72 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  29.22 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  31.41 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  35.45 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  32.54 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  31.54 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  33.57 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  32.87 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  30.1 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  31.43 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  28.87 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  30.82 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  32.05 
 
 
255 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  28.35 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  42.25 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  33.06 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>