47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00823 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  62.55 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  58.5 
 
 
236 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  54.13 
 
 
237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  58.95 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  50.48 
 
 
245 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  48.51 
 
 
238 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  52.53 
 
 
245 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  49.56 
 
 
247 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  46.48 
 
 
225 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  46.01 
 
 
225 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  45.88 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  38.86 
 
 
407 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  40.18 
 
 
407 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  40.37 
 
 
251 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  46.41 
 
 
241 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  39.06 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  43.5 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  46.95 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  40.6 
 
 
255 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  43.2 
 
 
226 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  48.68 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  43.5 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  43.58 
 
 
241 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  43.6 
 
 
174 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  42.62 
 
 
244 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  45.45 
 
 
235 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  39.36 
 
 
414 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  38.83 
 
 
414 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  41.38 
 
 
237 aa  151  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  38.69 
 
 
248 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  40.59 
 
 
215 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  40.59 
 
 
215 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  38.65 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  37.64 
 
 
213 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  37.35 
 
 
208 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  39.19 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 
211 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  35.96 
 
 
212 aa  92  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  35.19 
 
 
210 aa  89  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  34.64 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  35.12 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  33.59 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  28 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  26.88 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>