41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2847 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  192  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  50.54 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  37.11 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  36.84 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  30.43 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  38.2 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  36.36 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2670  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  35.44 
 
 
111 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  37.23 
 
 
103 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  34.15 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  37.29 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  37.93 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  32.22 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  32.26 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  30.21 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  39.29 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  25.56 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  29.79 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  30.69 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  30.11 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  27.47 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  27.17 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  31.33 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  29.35 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  42  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  42  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  28.57 
 
 
111 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  34.04 
 
 
115 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  26.58 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  31.82 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  30.59 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>