170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2555 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08096  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  36.7 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  33.98 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  32.38 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  33.02 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  33.02 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  34.58 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  31.73 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  29.52 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  29.52 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  33.02 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  29.52 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  29.52 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  37.61 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  29.52 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  32.69 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  37.37 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  28.57 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  28.57 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1729  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000131662  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  31.37 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0799  hypothetical protein  31.96 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283933  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  32.38 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  33.72 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  32.32 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  32.35 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  32.32 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0797  hypothetical protein  38.82 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.891602  normal  0.0353657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  30.61 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  31.31 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  31.73 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  30.19 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  33.02 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  33.02 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  35.51 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  31.96 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  26.67 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  34.62 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  33.02 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  30.3 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  31.13 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  32.11 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  32.11 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  33.96 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  33.96 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  29.7 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  31.13 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  31.13 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  32.11 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  31.68 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  29.29 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  34.07 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  30.19 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  29.29 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  30.84 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  32.11 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  30.19 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  30.84 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  35.96 
 
 
115 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  26.92 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  26.73 
 
 
109 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  31.78 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  28.97 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  30.85 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  27.1 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  30.19 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0542  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  29.52 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  34.07 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  34.07 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  31.87 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  30.84 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  30.84 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  27.18 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  30.77 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  23.08 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  32.04 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  26.47 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  24.75 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  28.42 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  26.21 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>