52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2178 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 160 aa  330  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  46.88 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  49.07 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  29.55 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  26.56 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  35.87 
 
 		 302 aa  53.9  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 279 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 277 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 279 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 288 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 300 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 300 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 300 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  25.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 284 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.29 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  37.93 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  24.71 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 290 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 285 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  31.51 
 
 		 281 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 271 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 291 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 290 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 290 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 289 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  26.22 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>