18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2081 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2081  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  976    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.40014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2702  Beta-agarase  29.46 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0145383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3029  agarase  27.6 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.933436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2419  agarase  27.07 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.0278267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50830  hypothetical protein  24.32 
 
 		 757 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4624  agarase  33.71 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1162  Beta-agarase  24.84 
 
 		 744 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1126  Beta-agarase  25.05 
 
 		 782 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2642  agarase  30.65 
 
 		 782 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4289  Beta-agarase  24.84 
 
 		 744 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19460  Agarase  24.86 
 
 		 801 aa  94  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1147  Beta-agarase  27.17 
 
 		 755 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.821905  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3553  hypothetical protein  23.72 
 
 		 658 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1226  hydrolase, putative  26.73 
 
 		 826 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1176  agarase  32.63 
 
 		 777 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000515097  unclonable  0.0000000139638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2644  GTPase EngC  26.25 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  0.285653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1971  agarase  25.41 
 
 		 793 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0111275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2640  agarase  24.24 
 
 		 813 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.503821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>