54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1933 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
64 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  78.33 
 
 
81 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  73.02 
 
 
64 aa  95.9  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  61.9 
 
 
63 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  61.9 
 
 
64 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  68.52 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  54.24 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  45.9 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  41.86 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  43.48 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  32.69 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  37.21 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  56.9 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  39.53 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  38.64 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  33.87 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  36.54 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  32.26 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  32.26 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  32.26 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  32.26 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  34.62 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  38.78 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  40.43 
 
 
57 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  40.43 
 
 
57 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>