More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2272 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  100 
 
 		 481 aa  955    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  52 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  41.82 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  37.86 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  26.5 
 
 		 350 aa  103  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  30.26 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  37.04 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  25 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  27.54 
 
 		 375 aa  86.7  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  27.32 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  33.59 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  33.59 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  33.59 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  33.59 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  33.59 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  28.69 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  30.1 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  32.21 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  32.58 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  32.58 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  25.91 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  28.47 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  28.8 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  29.17 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  32.12 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  32.12 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  29.85 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  24.28 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  25.88 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  27.08 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  27.7 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0198  SufBD  29.05 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  23.77 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.12 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.3 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  29.92 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  25.27 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  25.76 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  28.89 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  32.65 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  26.58 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  24.79 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1899  FeS assembly protein SufB  30.28 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.77 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  24.79 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  30.94 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  25.64 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  25.88 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.55 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.25 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  31.58 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  30.83 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  22.42 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  30.7 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  32.46 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  32.46 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  32.46 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  32.74 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  32.74 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1797  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.83 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4269  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.46 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  29.13 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  37.89 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  31.86 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  34.34 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 		 434 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.01 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0404  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30.3 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2573  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.17 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.01 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  24.74 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  31.86 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  31.86 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  32.74 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  31.86 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  31.86 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0893  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.01 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  22.9 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.23 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  32.74 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.57 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  29.01 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  31.29 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.57 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1192  FeS assembly protein SufB  26.28 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  31.29 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.23 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  26.23 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  32.41 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  31.29 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3151  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.46 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>