39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1393 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  42.44 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  43.37 
 
 
216 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  48.02 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  37.76 
 
 
240 aa  101  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  39.8 
 
 
229 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13410  hypothetical protein  31.8 
 
 
261 aa  90.9  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0987  flavocytochrome c  49.28 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  31.9 
 
 
598 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  28.88 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  33.63 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  32.74 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  41.79 
 
 
598 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.77 
 
 
596 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  39.34 
 
 
589 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  33.63 
 
 
150 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  44 
 
 
126 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  38.1 
 
 
135 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  34.85 
 
 
118 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  31.07 
 
 
126 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  33.33 
 
 
597 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.33 
 
 
596 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  33.33 
 
 
596 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  39.68 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  51.22 
 
 
591 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35.38 
 
 
589 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.48 
 
 
593 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  38.6 
 
 
120 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  33.04 
 
 
112 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  39.68 
 
 
127 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  36.36 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  39.29 
 
 
127 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  43.24 
 
 
155 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.1 
 
 
596 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.1 
 
 
596 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.1 
 
 
596 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.1 
 
 
596 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>