18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0987 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0987  flavocytochrome c  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  49.28 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 596 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  35.9 
 
 		 589 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  32 
 
 		 591 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  39.73 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.31 
 
 		 589 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.65 
 
 		 596 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  31.75 
 
 		 589 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.25 
 
 		 588 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  37.33 
 
 		 216 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  34.12 
 
 		 596 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 598 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  29.29 
 
 		 240 aa  41.2  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.99 
 
 		 593 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  34.52 
 
 		 596 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>