27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0571 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  99.1 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  99.1 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  98.2 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  98.2 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  98.2 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3426  HtrA suppressor protein SohA  97.83 
 
 		 46 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4443  HtrA suppressor protein SohA  95.65 
 
 		 46 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.621438 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  39.25 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  39.25 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  39.18 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  34.26 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  39.62 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  41.94 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  42.86 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  36.27 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  32.14 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  30.36 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  31.91 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  34 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>