59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4340 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  87.5 
 
 		 176 aa  324  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  81.71 
 
 		 203 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  70.29 
 
 		 203 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  67.05 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  62.86 
 
 		 203 aa  240  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  64 
 
 		 203 aa  240  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  66.86 
 
 		 202 aa  234  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  68.02 
 
 		 1097 aa  234  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  65.9 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  61.36 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  59.41 
 
 		 201 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  58.82 
 
 		 201 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  56.98 
 
 		 201 aa  217  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  56.98 
 
 		 201 aa  217  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  56.98 
 
 		 201 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  58.76 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  56.4 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  58.38 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  58.76 
 
 		 208 aa  201  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  56 
 
 		 202 aa  198  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  56.9 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  54.07 
 
 		 202 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  44.32 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  39.53 
 
 		 266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  35 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  36 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  36.57 
 
 		 220 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  32.37 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  34.32 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  35.59 
 
 		 234 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  38.41 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  35.62 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  34.93 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  34.93 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  37.84 
 
 		 433 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  35.61 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  42.98 
 
 		 219 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  32.96 
 
 		 228 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  37.41 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  34.16 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  36.17 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  38.98 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  39 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  30.39 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  42.71 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  36.04 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  35.29 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  27.91 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  29.83 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  29.83 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  29.83 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  44.78 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  31.58 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  27.54 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  34.29 
 
 		 696 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  35.85 
 
 		 422 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  27.78 
 
 		 354 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  33.33 
 
 		 747 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>