More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0953 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0953  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
133 aa  254  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0168  50S ribosomal protein L7/L12  92.48 
 
 
132 aa  195  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.640563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  44.7 
 
 
129 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0023  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  44.36 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  48.46 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  50.43 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  47.86 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  42.96 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  43.41 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  42.54 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  39.1 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  43.08 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  43.08 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  47.69 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  47.69 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  42.64 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  40.31 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  40.8 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  48.46 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  44.36 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  44.88 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  43.51 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  46.92 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  46.62 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  43.08 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  43.08 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  42.86 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  42.31 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  46.03 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  46.15 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  44.62 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  42.86 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  44.96 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  45.32 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  45.31 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  45.38 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  45.86 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  42.86 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  46.46 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  43.85 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  46.46 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  45.59 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  47.29 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  40.6 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  43.41 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  41.79 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  46.27 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  44.19 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  46.15 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  46.15 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  59.21 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  42.75 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  39.85 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  45.19 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  45.38 
 
 
125 aa  66.6  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  45.19 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  45.86 
 
 
124 aa  66.6  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  59.74 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  59.74 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  46.09 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  44.36 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  44.96 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  59.74 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  59.74 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  55.84 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  43.07 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  43.07 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  57.89 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  45.38 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  46.92 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  42.64 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  45.38 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  43.07 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>