84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0420 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  100 
 
 
258 aa  534  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  64.48 
 
 
259 aa  361  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  56.64 
 
 
258 aa  319  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  53.1 
 
 
255 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  51.54 
 
 
293 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  51.17 
 
 
257 aa  265  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  50.58 
 
 
299 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  50.2 
 
 
309 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 
298 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  46.9 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.13 
 
 
304 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 
255 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 
255 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  36.15 
 
 
252 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  37.25 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  33.21 
 
 
250 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
255 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  35.88 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
255 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  33.88 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  27.18 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  24.79 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24.23 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  26.91 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  22.37 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
352 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  22.03 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  24.57 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.54 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.32 
 
 
362 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
353 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  25.59 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  23.67 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  27.81 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  27.81 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  21.13 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  27.97 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  25.33 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  28.74 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  30.56 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  25.61 
 
 
335 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  33.67 
 
 
277 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
227 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  24 
 
 
336 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  23.25 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  28.95 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  24.56 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  21.97 
 
 
363 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
340 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.61 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  24 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  24.54 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  24.54 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
324 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  28.98 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  23.44 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
227 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.22 
 
 
385 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  20.43 
 
 
358 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  20.8 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  24.71 
 
 
337 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
330 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  23.43 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.95 
 
 
367 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  32.43 
 
 
331 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  26.83 
 
 
219 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  24.24 
 
 
335 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  23.61 
 
 
360 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.78 
 
 
227 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  28.95 
 
 
356 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.08 
 
 
516 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>