More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2741 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  69.83 
 
 
253 aa  343  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  57.26 
 
 
247 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.86 
 
 
265 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  47.6 
 
 
236 aa  208  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.96 
 
 
243 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.57 
 
 
249 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  46.09 
 
 
243 aa  204  9e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  46.05 
 
 
243 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.15 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.33 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.28 
 
 
269 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  40.42 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.26 
 
 
238 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  36.25 
 
 
265 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  47.68 
 
 
173 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  31.12 
 
 
227 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.06 
 
 
419 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  33.58 
 
 
285 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  37.58 
 
 
200 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  30.71 
 
 
227 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.06 
 
 
282 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  30.29 
 
 
227 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.31 
 
 
226 aa  99  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.08 
 
 
286 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  29.88 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.08 
 
 
286 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  30.2 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.34 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.59 
 
 
373 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.88 
 
 
222 aa  95.5  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.74 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  29.84 
 
 
379 aa  93.2  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.34 
 
 
370 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.65 
 
 
327 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.84 
 
 
382 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  30.42 
 
 
377 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.4 
 
 
368 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.39 
 
 
377 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.84 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.7 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.19 
 
 
398 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  27.37 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  27.37 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  27.37 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  27.37 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  27.37 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  28.63 
 
 
377 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  28.63 
 
 
386 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.81 
 
 
380 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.08 
 
 
225 aa  89  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.21 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.81 
 
 
379 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 
396 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  29.31 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  26.74 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  26.74 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  26.74 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  26.74 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  26.74 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.8 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.5 
 
 
379 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.23 
 
 
358 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.37 
 
 
294 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  26.37 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  26.74 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.53 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.84 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  26.61 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.06 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.81 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  25.63 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.62 
 
 
369 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  27.86 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  32.42 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  26.01 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.72 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  28.34 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.2 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.15 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  27.14 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.2 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  26.67 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.63 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  26.18 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.77 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  27.95 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  27.72 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.09 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.53 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  26.17 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.95 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  27.93 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.44 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  27.72 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.34 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.72 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.72 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  27.17 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>