More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0966 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  72.29 
 
 
229 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.37 
 
 
192 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.888786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 
166 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1423  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.43 
 
 
166 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0067  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.26 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.51 
 
 
139 aa  95.1  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0848344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  30.37 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  31.82 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.77 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  31.76 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.74 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  26.4 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  27.68 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.67 
 
 
175 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.35 
 
 
119 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  29.73 
 
 
136 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.71 
 
 
180 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  27.12 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  27.12 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  27.12 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  27.12 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
180 aa  61.6  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
182 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  32.5 
 
 
182 aa  61.6  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  34.07 
 
 
135 aa  61.6  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.61 
 
 
176 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  37 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  28.99 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.99 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.99 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.99 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  31.15 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.24 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  28.99 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.88 
 
 
129 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.07 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.34 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.41 
 
 
180 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.57 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.99 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.41 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
267 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.68 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.41 
 
 
180 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  28.26 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
137 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.41 
 
 
180 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.22 
 
 
175 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.22 
 
 
175 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.41 
 
 
180 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  33.04 
 
 
182 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  33.04 
 
 
182 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.66 
 
 
180 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.85 
 
 
135 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  33.33 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  34.13 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.84 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  29.37 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  25.77 
 
 
122 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
182 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3366  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.32 
 
 
124 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
176 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>