More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2902 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2902  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 333 aa  688    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  86.67 
 
 		 330 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.076505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.29 
 
 		 331 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.34 
 
 		 328 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  65.95 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  65.22 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.38 
 
 		 326 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.32 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.58 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.48 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.88 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 325 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.32 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.75 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.7 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.44 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.63 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.18 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  55.31 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.94 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.55 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.49 
 
 		 341 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.81 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.08 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  60.38 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.41 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.39 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.74 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.81 
 
 		 326 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.78 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.49 
 
 		 328 aa  364  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  55.76 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 		 327 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  56.03 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.98 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.59 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.77 
 
 		 352 aa  355  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.55 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  56.91 
 
 		 324 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1771  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.28 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.25 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.25 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0925  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.69 
 
 		 326 aa  351  8e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.41 
 
 		 323 aa  348  5e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.25 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 		 346 aa  345  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 		 331 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  51.88 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  55.62 
 
 		 325 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.25 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1362  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.83 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.414153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1772  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.99 
 
 		 331 aa  340  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 322 aa  340  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.75 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.5 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0015  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.767271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  53.42 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 		 322 aa  335  5e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 		 322 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.99 
 
 		 317 aa  335  9e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.04 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2019  Porphobilinogen synthase  52.12 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  55.73 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>