24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0846 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  57.45 
 
 
758 aa  804    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  47.85 
 
 
816 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  100 
 
 
782 aa  1571    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  36.73 
 
 
722 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  29.08 
 
 
736 aa  237  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  29.44 
 
 
704 aa  235  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21 
 
 
699 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  19.79 
 
 
712 aa  92  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  25.52 
 
 
713 aa  85.1  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  25.52 
 
 
713 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  30.69 
 
 
709 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  21.28 
 
 
699 aa  81.3  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  24.69 
 
 
713 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  23.94 
 
 
708 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.49 
 
 
715 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  21.57 
 
 
713 aa  57  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  22.51 
 
 
758 aa  56.2  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  33.72 
 
 
840 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  33.72 
 
 
837 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  31.58 
 
 
743 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  22.16 
 
 
729 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  37.14 
 
 
911 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.43 
 
 
851 aa  44.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  32.61 
 
 
1045 aa  44.3  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>