26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2808 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  44.82 
 
 
1030 aa  782    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  100 
 
 
1045 aa  2106    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  35.79 
 
 
1048 aa  533  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  34.94 
 
 
998 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  34.71 
 
 
961 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.86 
 
 
891 aa  295  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  27.66 
 
 
837 aa  295  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.12 
 
 
840 aa  293  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  27.82 
 
 
824 aa  268  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  25.54 
 
 
863 aa  214  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.74 
 
 
884 aa  212  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  26.14 
 
 
868 aa  208  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.31 
 
 
812 aa  195  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.44 
 
 
872 aa  183  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  25.51 
 
 
815 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  22.53 
 
 
840 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  27.02 
 
 
808 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  22.99 
 
 
836 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.3 
 
 
854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.29 
 
 
881 aa  118  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.17 
 
 
2073 aa  82.8  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  23.61 
 
 
768 aa  65.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.09 
 
 
736 aa  63.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.39 
 
 
704 aa  61.2  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  25.96 
 
 
712 aa  51.6  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0090  hypothetical protein  41.07 
 
 
820 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>