More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0762 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0762  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1168  glycosyl transferase family protein  54.68 
 
 
330 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1590  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.7 
 
 
331 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
324 aa  142  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
324 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
324 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.39 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
1162 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.34 
 
 
652 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
358 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
387 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
328 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
1077 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
298 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
705 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
317 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.1 
 
 
1119 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
714 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.01 
 
 
2401 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
785 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.27 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  21.77 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
1340 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
1523 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  22.81 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
677 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
705 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.27 
 
 
326 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4188  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
644 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
337 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
280 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
326 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 
1268 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  21.4 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  35.09 
 
 
349 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
528 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3317  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.18 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  39 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>