More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1708 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  97.6 
 
 
208 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  76.12 
 
 
204 aa  285  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  73 
 
 
202 aa  274  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  69.85 
 
 
200 aa  270  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  68.66 
 
 
200 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  69.35 
 
 
202 aa  266  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  74.5 
 
 
201 aa  255  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  62.31 
 
 
200 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  73.74 
 
 
204 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  65.66 
 
 
202 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  60.3 
 
 
207 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  60.3 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  55.61 
 
 
208 aa  208  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  60.8 
 
 
200 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  58.21 
 
 
209 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  57.71 
 
 
209 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  58.71 
 
 
228 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  53.81 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  62.31 
 
 
207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  57.71 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  58.13 
 
 
204 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  58.21 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  57.21 
 
 
210 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  57.21 
 
 
210 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  57.21 
 
 
210 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  58.64 
 
 
210 aa  191  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  57.07 
 
 
210 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  61.19 
 
 
209 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  58.71 
 
 
210 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  50.76 
 
 
206 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  45.54 
 
 
207 aa  158  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.73 
 
 
201 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  49.75 
 
 
202 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  47.26 
 
 
203 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  45.18 
 
 
201 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  47.52 
 
 
205 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  45.96 
 
 
203 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.16 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  45.92 
 
 
202 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  46.46 
 
 
203 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  46.57 
 
 
194 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  42.13 
 
 
192 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  45.32 
 
 
194 aa  141  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  45.45 
 
 
213 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  40.8 
 
 
198 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  45.02 
 
 
202 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  45.27 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  45.1 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  45.1 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  36.71 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  45.6 
 
 
196 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  46.97 
 
 
196 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  41.92 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  42.79 
 
 
196 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  43.15 
 
 
210 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  43.88 
 
 
199 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  51.9 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  45.96 
 
 
203 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  45.41 
 
 
189 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  44.44 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  41.58 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  41.12 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  43.78 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  43.28 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  41.12 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  44.44 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  41.12 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  44.44 
 
 
202 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  43.15 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  43.72 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  37.82 
 
 
191 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  42.08 
 
 
198 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  42.21 
 
 
194 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  42.21 
 
 
194 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  42.93 
 
 
193 aa  131  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  40.1 
 
 
192 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  41.12 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  41.92 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  41.45 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  44.72 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  44.72 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  41.26 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  41.26 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  41.26 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  41.26 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  40.5 
 
 
194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  41.45 
 
 
197 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  41.45 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  42.29 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  41.21 
 
 
194 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  40.59 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  42.29 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  40.59 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>