More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3838 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3838  small GTP-binding protein  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2719  GTP-binding protein, HSR1-related  76.34 
 
 
261 aa  417  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0076047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  60.66 
 
 
716 aa  298  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1406  GTP-binding protein, HSR1-related  56.5 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1972  small GTP-binding protein  56.5 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0845382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02710  Ferrous iron transport protein FeoB  54.47 
 
 
262 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2275  small GTP-binding protein  55.66 
 
 
244 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3772  GTP-binding protein HSR1-related  54.08 
 
 
271 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0842  ferrous iron transport protein B, N- region  55.45 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4511  small GTP-binding protein  59.63 
 
 
276 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154216  normal  0.99692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0768  ferrous iron transport protein B, N- region  55.45 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0679  ferrous iron transport protein B  55.45 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0623  ferrous iron transport protein B, N-terminal region  55.45 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0748  ferrous iron transport protein B  55.45 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4589  ferrous iron transport protein B  55 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0629  small GTP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  255  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0601  small GTP-binding protein  55.41 
 
 
240 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1538  GTP-binding protein, HSR1-related  51.77 
 
 
259 aa  251  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0623  ferrous iron transport protein B  55.91 
 
 
240 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000038054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  52.31 
 
 
725 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  53.18 
 
 
720 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1009  ferrous iron transport protein B  51.5 
 
 
707 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0206507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  42.79 
 
 
720 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  46.82 
 
 
680 aa  191  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  42.49 
 
 
680 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  44.59 
 
 
676 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1266  GTP-binding protein, HSR1-related  45.34 
 
 
689 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  44.5 
 
 
743 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  42.73 
 
 
743 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  42.54 
 
 
724 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  43.78 
 
 
732 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  44.75 
 
 
741 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0850  ferrous iron transport protein B  46.45 
 
 
695 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  44 
 
 
688 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  43.87 
 
 
786 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  40.93 
 
 
662 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  41.11 
 
 
747 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  42.41 
 
 
778 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3545  small GTP-binding protein  56.76 
 
 
177 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1569  ferrous iron transport protein B  43.98 
 
 
659 aa  171  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000694144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4259  small GTP-binding protein  50.61 
 
 
176 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1209  small GTP-binding protein  54.82 
 
 
609 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  44.7 
 
 
741 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  40.99 
 
 
665 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  41.1 
 
 
657 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2063  ferrous iron transport protein B  38.6 
 
 
944 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000695789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  43.44 
 
 
770 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  38.18 
 
 
822 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0571  ferrous iron transport protein B  43.72 
 
 
845 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237546  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  43.75 
 
 
646 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  42.59 
 
 
713 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  43.44 
 
 
770 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  42.79 
 
 
665 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  40.55 
 
 
826 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0554  small GTP-binding protein  50.92 
 
 
176 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  44.09 
 
 
669 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  42.25 
 
 
725 aa  164  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  39 
 
 
646 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  39.46 
 
 
647 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  44.95 
 
 
740 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  43.58 
 
 
669 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  44.65 
 
 
738 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  43.6 
 
 
749 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  42.92 
 
 
712 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  42.03 
 
 
669 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  40.17 
 
 
722 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  41.06 
 
 
667 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  39.04 
 
 
778 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  39.53 
 
 
725 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  41.88 
 
 
783 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  39.29 
 
 
666 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  40.09 
 
 
712 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  39.01 
 
 
647 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  44.13 
 
 
728 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  42.92 
 
 
713 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  42.4 
 
 
669 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  40 
 
 
759 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  40.89 
 
 
776 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  43.72 
 
 
740 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  48.7 
 
 
631 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  40.43 
 
 
824 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  38.57 
 
 
647 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  40.37 
 
 
712 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  51.3 
 
 
631 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  35.34 
 
 
697 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  42.53 
 
 
778 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  40.55 
 
 
723 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  40.36 
 
 
666 aa  154  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  42.67 
 
 
676 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  40.48 
 
 
628 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  38.79 
 
 
715 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  38.79 
 
 
717 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  40.37 
 
 
712 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  39.33 
 
 
704 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  43.32 
 
 
676 aa  149  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  38.32 
 
 
717 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  40.44 
 
 
662 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  41.43 
 
 
712 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  39.08 
 
 
714 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  39.91 
 
 
721 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>