81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3511 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3511  Radical SAM domain protein  100 
 
 
475 aa  973    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000437292  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1235  radical SAM family protein  41.7 
 
 
470 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01990  Radical SAM domain protein  34.54 
 
 
447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.412201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0404  Radical SAM domain protein  32.91 
 
 
458 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.08 
 
 
344 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.67 
 
 
341 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.51 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.45 
 
 
330 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.58 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.47 
 
 
455 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 
332 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.23 
 
 
361 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
336 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  33.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  33.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  33.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  33.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  33.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  33.88 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  33.88 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  33.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 
292 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 
359 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
328 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  31.71 
 
 
474 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.24 
 
 
427 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
323 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.93 
 
 
298 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5689  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  25.53 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  33.75 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.77 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
296 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
326 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 
422 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 
340 aa  47  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 
333 aa  47  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 
327 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  28.93 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  36.17 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.63 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.71 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1291  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.21 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 
329 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 
332 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  30.11 
 
 
479 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  28.43 
 
 
649 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
307 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  31.9 
 
 
279 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
329 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 
321 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.66 
 
 
317 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.45 
 
 
325 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  24.32 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.32 
 
 
340 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.65 
 
 
326 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
481 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
299 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.75 
 
 
322 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.38 
 
 
367 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
368 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 
323 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
443 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
334 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>