57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1584 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1584  putative RNA polymerase sigma factor SigI  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2309  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.93 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3361  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.02 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0602386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1128  putative RNA polymerase sigma factor SigI  41.4 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0832  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.5 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1048  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.5 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0661  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.3 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00767119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1698  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.68 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.734467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2112  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.89 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4761  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.63 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0074  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.67 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0058  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.78 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2038  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.13 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3122  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.91 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1739  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.49 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0403  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.06 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0521455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3204  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.13 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0084081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3445  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.65 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3441  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.13 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.246792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3483  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.65 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2521  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.86 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000234194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3231  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.65 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.625131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3433  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.13 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1813  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.13 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3137  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.65 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2975  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.05 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0315  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.22 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0268  putative RNA polymerase sigma factor SigI  28.96 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2120  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.64 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1272  putative RNA polymerase sigma factor SigI  29.86 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0944  putative RNA polymerase sigma factor SigI  30.37 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000529876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1805  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  45.45 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1921  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.65 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0689  RNA polymerase sigma factor SigF  29.17 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0670  RNA polymerase sigma factor SigF  29.17 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  33.33 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1297  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  29.52 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000823001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0407  RNA polymerase factor sigma-70  27.68 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0429  sigma 28 (flagella/sporulation)  28.24 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0400  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.14 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0319697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0009  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  34.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000498773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1130  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  26.83 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.938596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  28.4 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3053  RNA polymerase sigma factor for flagellar operon  28.24 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2968  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  27.03 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2055  RNA polymerase sigma factor SigF  29.11 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3447  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1686  RNA polymerase sigma factor SigF  29.27 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3085  RNA polymerase sigma factor SigF  28.57 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4416  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  28.75 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.197457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0402  RNA polymerase factor sigma-70  28.97 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.38021e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  30.48 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0088  RNA polymerase factor sigma-70  27.68 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000937894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1281  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  24.21 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2351  RNA polymerase factor sigma-70  29.46 
 
 		 216 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0946718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4485  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  29.55 
 
 		 263 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.719923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  27 
 
 		 245 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>