25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4212 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  100 
 
 		 367 aa  717    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  50.42 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  50.42 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  50.97 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  45.83 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  41.52 
 
 		 391 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  41 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  36.14 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  39.06 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  41.26 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  40.81 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  41.75 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  37.74 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  37.74 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  33.85 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  34.59 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  30.04 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  27.27 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  27.38 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  36.36 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  29.95 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  28.98 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  33.06 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  33.09 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  29.29 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>