114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3247 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  45.24 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  47.62 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  47.62 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  43.75 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  46.03 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  40.62 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  31.65 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  34.19 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.5 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  28.69 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  28.45 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  27.59 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  33.96 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  32.28 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.2 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  36.44 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  28.57 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  27.19 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  31.53 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.96 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  30.7 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.2 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.06 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  35 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.69 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.53 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  27.59 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.83 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  27.68 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.64 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  27.68 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  25.44 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  28.45 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.36 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  27.83 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  25.78 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.87 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.48 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.31 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  31.09 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.32 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  31.3 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  28.07 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  24.14 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  29.29 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  29.29 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  27.83 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.95 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  30.1 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  30.19 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.5 
 
 		 165 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.45 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  25.41 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>