259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2586 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2586  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2691  HpcH/HpaI aldolase  58.23 
 
 
254 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02555  hypothetical protein  44.63 
 
 
249 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0507  putative HpcH/HpaI aldolase  43.9 
 
 
253 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208943  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3855  HpcH/HpaI aldolase  40.89 
 
 
253 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0115  HpcH/HpaI aldolase  40.65 
 
 
263 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0838  HpcH/HpaI aldolase  45.87 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  40.66 
 
 
261 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3485  HpcH/HpaI aldolase  40 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.547567  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1628  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  38.04 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5135  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3060  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal  0.0341829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1457  HpcH/HpaI aldolase  38.32 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3740  HpcH/HpaI aldolase  36.44 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  39.46 
 
 
264 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3014  putative aldolase protein  35.63 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0156  HpcH/HpaI aldolase family protein  36.33 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0359  HpcH/HpaI aldolase family protein  36.33 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2368  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0175  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2791  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2288  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0140  HpcH/HpaI aldolase family protein  35.77 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0164  HpcH/HpaI aldolase family protein  36.33 
 
 
319 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  28.51 
 
 
254 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3113  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.46 
 
 
261 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3171  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537905  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.71 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  33.47 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3054  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0320  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.07 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.68 
 
 
261 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.69 
 
 
259 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.54 
 
 
261 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4404  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.82 
 
 
260 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6205  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.6 
 
 
256 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424474  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  30.51 
 
 
258 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0046  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.8 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1624  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.34 
 
 
253 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2502  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3116  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2517  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.36 
 
 
254 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 
259 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 
259 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  38.24 
 
 
259 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  33.33 
 
 
256 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1499  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.35 
 
 
266 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3132  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.56 
 
 
261 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  30.49 
 
 
273 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  33.78 
 
 
256 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  33.78 
 
 
256 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  33.78 
 
 
256 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  34.48 
 
 
256 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  33.78 
 
 
256 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  33.78 
 
 
256 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  30.99 
 
 
254 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.44 
 
 
256 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4135  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  38.22 
 
 
253 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.960195  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.44 
 
 
256 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  29.18 
 
 
258 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  34.48 
 
 
256 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3456  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.52 
 
 
254 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.44 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0579  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.44 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3315  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.44 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1111  HpcH/HpaI aldolase  35.98 
 
 
251 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0589091  normal  0.717046 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4438  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.867031  normal  0.323849 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02942  hypothetical protein  32.44 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0574  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.44 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.8 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3463  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.26 
 
 
254 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.76 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.43 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.43 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1797  HpcH/HpaI aldolase  29.07 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  0.716288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  30.43 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  30.43 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00850  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1776  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.07 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170992  normal  0.538418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3232  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0239  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.5 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0497  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.15 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.37 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  30.43 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3079  HpcH/HpaI aldolase  33.63 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3136  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  25.78 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.98 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  39.23 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0871  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.55 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2380  HpcH/HpaI aldolase  30.24 
 
 
253 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10570  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.28 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8637  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0844  hydroxyacid aldolase, putative  29.44 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4207  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.77 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1475  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.47 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09230  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.91 
 
 
301 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3577  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.62 
 
 
267 aa  92.4  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  28.51 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.88 
 
 
266 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>