59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0393 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  63.46 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  45.76 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  48.53 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  40 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  45.45 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  36.62 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  42.59 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  42.86 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  40.32 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  40.38 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  48.72 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  38.81 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  43.1 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  37.1 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  40.74 
 
 		 65 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  40.74 
 
 		 65 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  36.76 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  37.93 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  43.9 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  43.1 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  45.65 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 97 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  45.24 
 
 		 66 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  38.6 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  37.7 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  35.71 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  41.38 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  38.33 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  38.18 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  41.38 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  41.38 
 
 		 108 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>