31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0287 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  100 
 
 		 415 aa  822    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2290  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.61 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.6 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 612 aa  50.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  26.47 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  23.53 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 437 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  26.04 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  29.3 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  29.25 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  26.15 
 
 		 597 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  29.3 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  29.3 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  22.22 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  29.3 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  29.3 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  23.03 
 
 		 500 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  22.88 
 
 		 594 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  24.56 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  24.52 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  24.56 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  24.76 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>