More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3124 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  56.65 
 
 
238 aa  287  9e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.33 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.88 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.95 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
225 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.91 
 
 
223 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.14 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
235 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  31.79 
 
 
223 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.84 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.16 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.09 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  32.99 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  28.95 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  32.99 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.96 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.64 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  31.98 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  28.88 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  28.48 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  32.49 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.49 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  30.05 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.29 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.12 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
262 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.9 
 
 
256 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.09 
 
 
257 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
267 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.37 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  28.76 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  31.98 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.79 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3179  enoyl-CoA hydratase  27.08 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.825249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.64 
 
 
695 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.04 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  29.47 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.78 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  29.35 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54494  enoyl-coa hydratase  29.82 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.963819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  27.09 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.24 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  27.73 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.65 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.81 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>