36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2590 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
295 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  28.77 
 
 
241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  27.23 
 
 
253 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  31.78 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  31.13 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  28.45 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  24.76 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  27.49 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  24.29 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  29.83 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  24.14 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  26.24 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  24.51 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  29.19 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  21.53 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  23.29 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  30.17 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  25.23 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  24.24 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  33.82 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  24.49 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  23.56 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  22.92 
 
 
247 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  23.81 
 
 
249 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  22.98 
 
 
256 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  24.14 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  24.2 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  26.42 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  23.3 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  24.05 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  18.84 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  22.4 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  24.32 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  26.61 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  23.63 
 
 
246 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  23.63 
 
 
246 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>