21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2560 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  86.67 
 
 
186 aa  318  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  58.29 
 
 
176 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  61.94 
 
 
194 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  61.29 
 
 
196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  53.37 
 
 
185 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  43.71 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  46.45 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  42.29 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  43.83 
 
 
412 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  46.79 
 
 
153 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  47.73 
 
 
339 aa  117  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  40.86 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  44.92 
 
 
254 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  53.85 
 
 
124 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  42.03 
 
 
358 aa  98.6  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  66.18 
 
 
68 aa  91.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  35.77 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  35.14 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  52.46 
 
 
109 aa  62  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  43.08 
 
 
132 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>