More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2463 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2463  ribonuclease III  100 
 
 
315 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
319 aa  170  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
324 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.32 
 
 
322 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.32 
 
 
322 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  31.32 
 
 
322 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
322 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.32 
 
 
322 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  31.32 
 
 
322 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.32 
 
 
322 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
320 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
310 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.96 
 
 
322 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
342 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.39 
 
 
327 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 
316 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.14 
 
 
327 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
329 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.14 
 
 
327 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.14 
 
 
327 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.14 
 
 
327 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.04 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.98 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.73 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
312 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
320 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 
318 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
320 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.21 
 
 
316 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
326 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
314 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
343 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
327 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
314 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
336 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  35.27 
 
 
320 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
336 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
320 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
331 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
331 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.53 
 
 
327 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  30.96 
 
 
332 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
337 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
312 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
345 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
345 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
345 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  34.51 
 
 
329 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  30.19 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
344 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
340 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
341 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
358 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
318 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
334 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
312 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
349 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  28.85 
 
 
347 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 
343 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.71 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.71 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
344 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
319 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
368 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.48 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.48 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.48 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.48 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.63 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
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NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
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NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.3 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  30.5 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  30.5 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
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NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
398 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
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NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
334 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
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NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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